皂苷是許多中草藥如人參、遠志、桔梗、甘草、知母和柴胡等的主要有效成分之一，藥理研究表明皂苷類成分具有抗菌、抗腫瘤、調節機體代謝及免疫、治療心血管疾病和糖尿病等的生物活性。采用色譜-質譜連用法進行皂苷體內代謝產物分析，為闡明中藥的治病機制提供有利的證據。
液相色譜-質譜聯用（LC/MS）技術是一項集高效液相色譜HPLC的高分離性能與串聯質譜的高靈敏度、高專屬性優點于一身的生物分析技術，它不需要分析物之間實現完全的色譜分離，其多窗口檢測功能允許同時對多個成分進行定量分析。美迪西是一家臨床前CRO公司，提供新藥研發外包服務，其生物分析服務部門擁有專業的科研團隊，分析實驗室配置先進的儀器設備，實行全面的信息化管理，實驗研究符合FDA/CFDA GLP標準要求，服務內容涉及藥代動力學、藥效學、免疫原性和生物等效性等研究方面，為客戶提供小分子藥物、生物制劑、疫苗和生物標記物的篩選與開發，以及臨床前和臨床研究。
中草藥及其方劑成分復雜，HPLC與UV或DAD檢測器相聯接，對于單個色譜峰僅能提供保留時間及紫外吸收等信號，而對未知成分所能提供的結構信息相當有限。色譜峰的指認必須有對照品，而大多數中藥化學成分的對照品很難獲得，而對于體內中藥藥物分析，一般的檢測技術也難以滿足給藥后血藥濃度的測定要求，，
HPLC/MS的應用可以集HPLC的高分離效能與串聯質譜的高靈敏度、高專屬性的優點于一體，，并能夠給出被測組分的分子量信息，通過多級串聯質譜分析，還可以得出被測物質的結構信息。
1、液相色譜串聯質譜法進行人血液中偽人參皂苷代謝產物分析
建立液相色譜串聯質譜法測定人血漿中偽人參皂苷GQ濃度。在血漿樣品中加入適量內標，以乙酸乙酯萃取后采用Waters Xevo TQS
LC-MS/MS進行分析。采用Poroshell 120 EC C8色譜柱(2.1 mm×50 mm,2.7μm)，柱溫40℃，以甲醇-10 mmol·L-1醋酸銨水溶液(80∶20)為流動相，流速0.3 m
L·min-1;采用多反應離子監測(MRM)的掃描模式，以電噴霧離子源(ESI)在負離子電離模式下進行測定。
該方法的線性范圍為2.500~5
000 ng·m L-1，最低定量限為2.500 ng·m L-1，日內、日間精密度均小于15%，準確度在85%~115%之間，萃取回收率約9%~11%，基質效應約66%~73%，穩定性考察結果良好。藥動學試驗結果表明，靜注偽人參皂苷GQ 120 mg·次-1，每日1次，連續用藥5 d后，達峰時間為2 h，半衰期約10 h。試驗第1 d和第5 d主要藥代動力學參數基本一致，計算蓄積系數分別是RC max=0.964±0.099，和RAUC=0.965±0.181，兩者均接近1。
該方法適用于偽人參皂苷GQ的人體藥代動力學研究。在此給藥方案下,偽人參皂苷GQ在人體內沒有明顯蓄積現象，連續給藥不影響偽人參皂苷GQ的人體藥代動力學過程。
2、LC-MS/MS進行大鼠血液中丫蕊花皂苷代謝產物分析
采用高效液相-串聯質譜(LC-MS/MS)法測定大鼠血漿中丫蕊花皂苷G的含量，并研究其在大鼠體內的藥動學特征。方法采用Phenomenex Luna C18色譜柱(150 mm×2 mm,3μm)，流動相為乙腈-水(含0.1%甲酸)，流速0.2 mL·min~(-1)，以人參皂苷Rg3為內標；分別于大鼠尾靜脈注射丫蕊花皂苷G 0.25、0.5、1 mg·kg-1，給藥后于不同時間點采血，經固相萃取法處理后，采用上述LC-MS/MS法測定血藥濃度；采用DAS 3.0軟件、非房室模型擬合藥代參數。結果 0.01~1.0μg·m L-1丫蕊花皂苷G與峰面積的線性關系良好，方法學考察均符合要求；大鼠靜脈給藥后的血漿藥動學參數為:t1/2=3.447±0.898 h、MRT0-∞=4.568±1.075 h、CL=0.858±0.171
L·h-1·kg，AUC、Cmax隨給藥劑量的增加而等比增大，符合線性藥動學特征。此方法簡便、靈敏,結果準確,適用于大鼠血漿中丫蕊花皂苷G的含量測定及其藥動學研究。
也有研究者采用HPLC-ESI-MS/MS方法對血塞通注射液中皂苷進行定性定量分析。還有研究者采用加壓溶液萃取法（PLE）與HPLC-DAD-MS技術測定人參葉和人參中9種皂苷及2種聚乙炔醇類化合物（人參環氧炔醇，人參醇），這是一種快速檢測中藥的方法，對于控制人參的質量很有幫助。
建立可靠的分析方法是進行藥物體內代謝產物分析的前體，隨著現代色譜聯用技術的發展，體內多微量代謝產物的分離、鑒定已經成為了一個連續過程。尤其是LC-MS樣品前處理簡單，一般不要求水解或衍生化處理，運用LC-MS技術不僅可以避免復雜繁瑣的分離、純化代謝產物的工作，而且可以分離鑒定難以辨識的體內痕量代謝產物。
