PCR臨床基因擴增檢驗技術
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下一篇 2012-07-03 14:24:40
1.從引物自身著手,重新設計引物,這是最根本解決這一問題的辦法。
2.可能模板有問題,模板濃度過小,適當加大模板量。
3.Taq酶,引物,Mg2+濃度可能過高,可降低它們的濃度。
4.將上下引物混合后,在100℃的沸水中煮5分鐘,然后迅速拿出至于冰塊之上瞬時冷卻,這時再加入反應體系當中,引物二聚體就會消失的。理由:引物可能會發生發夾結構,自身環化等結構,在100℃的沸水中煮5分鐘可使引物變為單鏈,以減少二聚體。不過有人認為在PCR儀上95度變性5min也同樣達到目的,而且成功試過通過延長退火時間也可以消除引物二聚體。
5.所配MIX中加5%的甘油或者5%的DMSO,可以增強特異性。
6.PCR反應體系的配制在冰上進行,最后加Taq酶,PCR結束后,產物勿放置在室溫下過長時間,有人認為室溫下有些Taq酶會將多余的引物合成為二聚體。
7.增加循環數
8.降低退火溫度后有條帶,則應逐漸提高溫度,若提高溫度的同時產物量減少,則考慮增加Mg2+濃度(根據擴增片斷長度而定,片段長則相應鎂離子濃度應該高一些)。
9.若降低退火溫度,發現還是只有引物二聚體,而且鎂離子的濃度在20-25mmol/l沒有區別,則考慮Buffer等試劑沒有完全融解、混勻,導致吸取的試劑濃度不對。
10.以上次的PCR產物作模板二次PCR,可以提高引物與模板的特異性,減少引物二聚體,如果兩次時間間隔短的話,可以把原產物稀釋100-1000倍,如果間隔較長可以稀釋50-100倍。
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