寡肽轉運體基因組學研究獲進展
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下一篇 2011-10-13 16:09:32
近日來自中國科學院昆明植物研究所的研究人員在基因組學領域專業期刊BMCgenomics雜志上發表了題為“Analysesoftheoligopeptidetransportergenefamilyinpoplarandgrape”的研究論文。
中國科學院昆明植物研究所、青藏高原研究所昆明部楊永平研究員與胡向陽研究員、美國東卡羅來納州立大學的黃錦嶺教授與江蘇大學的曹軍博士為這篇文章的共同通訊作者。
寡肽是一類由幾個氨酸酸縮合成的短肽,寡肽不僅可以作為生物體物質能量代謝所必需的碳源或氮源,它本身也可以作為信號分子發揮多種生物學功能,而寡肽轉運體的主要功就是高效地將寡肽從胞外轉運到胞內。寡肽轉運體的研究相比集中在細菌與動物方面,植物寡肽轉運體的相關研究相對較少。
在這篇文章中,研究人員報告了近期對于楊樹與葡萄中的寡肽轉運體基因家族展開的基因組學研究的新成果。進化樹分析表明楊樹與葡萄中的OPT家族基因明顯呈現出兩個分枝,進一步可以細化成十個分枝;OPT家族基因在染色體中呈現非隨機的串聯重復方式分布,暗示基因重復在楊樹與葡萄中適應性進化中的重要作用;基因芯片結果表明楊樹與葡萄中的OPT家族基因參與了生長發育及多種逆境響應過程;正選擇分析表明整個OPT基因家族受到強烈的負選擇,但是針對某些特定的位點,進化壓力依舊表現出正選擇,并且這些位點都是膜外或膜內,表明這種選擇與環境適應之間的相關性。這些結果有助于我們進一步理解植物OPT基因家族的進化與功能適應。
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