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  • 細胞色素催化尼古丁反應機理研究獲進展

    上一篇 / 下一篇  2011-05-26 10:53:28

      中科院大連化學物理研究所復雜分子體系反應動力學研究組(1101組)與該所高級伙伴研究員、美國肯塔基大學湛昌國教授合作,在細胞色素P450 2A6催化尼古丁反應機理研究方面取得了新進展。

      酶催化反應機理是當今計算化學研究中的前沿領域和熱門課題。理論計算作為一種有力的手段,能夠研究酶催化反應的過程,解釋實驗現象,闡明反應機理,并為進一步的實驗研究提供理論基礎。尼古丁是煙草中的主要成癮物質,它在人體中的代謝主要是由細胞色素P450 2A6(CYP2A6)催化的,研究尼古丁和CYP2A6的結合方式以及CYP2A6催化尼古丁的反應機理能夠為合理設計CYP2A6抑制劑提供理論支持,為戒煙藥物的研發提供一定的理論基礎。

      大連化物所1101組自2006年以來一直致力于酶催化反應機理的理論研究,并相繼在J. Phys. Chem. B; ChemBioChem; J. Biol. Inorg. Chem.; Dalton Trans.等雜志上發表了一系列文章。近期,韓克利研究員等人與湛昌國教授合作,利用分子對接、分子動力學模擬、QM/MM計算等方法,研究了尼古丁與CYP2A6的結合方式、CYP2A6催化的尼古丁5'-羥基化反應的機理以及5'-羥基化反應的立體選擇性。結果表明,雖然尼古丁在溶液中主要以質子化的形式存在,但是它以非質子化的形式(SRt和SRc)結合到CYP2A6的活性中心。在CYP2A6-尼古丁復合物中,尼古丁吡啶環的N與CYP2A6的Asn297 形成氫鍵,吡啶環與周圍的苯丙氨酸存在π-π相互作用,吡咯烷環的trans-5'-H或者cis-5'-H指向CYP2A6的活性中心Cpd I的O,從而利于5'-羥基化反應的發生。

      研究發現,CYP2A6催化的尼古丁5'-羥基化反應由兩步組成:第一步是尼古丁的 5'-H傳遞到Cpd I的O上(氫傳遞);第二步是OH再與尼古丁的5'-位置的C結合,形成5'-羥基尼古丁(氧反彈)。其中,氫傳遞是決速步驟。計算結果顯示,CYP2A6催化的尼古丁5'-羥基化反應容易發生在trans-5'-H上,反應的立體選擇性為97%,與實驗報導的立體選擇性相符。

      相關論文發表在近期出版的《美國化學會志》上(J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 7416-7427)。(來源:中科院大連化學物理研究所)


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