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850K突破性升級！935K甲基化芯片重磅來襲
檢測DNA甲基化，精確到單堿基分辨率的高通量方式，物種是人，樣本不限，可能是FFPE樣本，也可能是檢測血液中cfDNA，甲基化芯片是最方便、性價比最高的粗篩方式。
從450K，到850K，再到如今的935K甲基化芯片，可檢測的甲基化位點也在不斷地增多，那么相較于之前的產品，935K有了什么新的變化？
935K甲基化芯片官方名稱為Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit，是一種全基因組甲基化篩選工具，靶向人類甲基化組最具生物學意義的區域中超過935,000個CpG位點，同時在其前代產品MethylationEPIC v1.0（850K甲基化芯片）的基礎上極大的提高了向后兼容性。該芯片保留了以單核苷酸分辨率定量分析全基因組CpG的能力，同時提供高度準確和精確的甲基化測量，不受測序深度的影響。
與舊版芯片相比935K具有更好的向后兼容性
——Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip建立在Infinium MethylationEPIC v1.0和HumanMethylation450 BeadChips的現有CpG主鏈上
作為另一項改進，Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChip上覆蓋不足的CpG島和外顯子被額外的探針完全覆蓋。此外，在新版本中查詢到超過450個癌癥驅動基因突變，這使得Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip成為癌癥研究的多組學工具。
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全基因組，前沿內容
根據專家對EPIC v1.0的評估，去除了性能不佳的探針，替換為前沿內容，以便為表觀遺傳學研究提供更強大的發現能力。EPIC v2.0上新增的186,000個CpG靶向增強子和超級增強子、更多CTCF結合位點、CNV檢測區域、EPIC v1.0覆蓋不足的CpG島以及常見癌癥驅動突變。更新后的v2.0 Beadchip也可分析通過ATAC-Seq和ChIP-seq實驗鑒定的染色質開放區域。
具體體現：
?在多種癌癥的腫瘤和正常樣本中發現的不同甲基化位點
?ChIP-Seq在癌癥和細胞系樣本中識別的增強子和超增強子
?使用ATAC-Seq在原發性人類癌癥中識別的不同可訪問染色質區域
?擴大CpG島的覆蓋范圍
?增強外顯子覆蓋范圍，以實現更準確的拷貝數變化（CNV）檢測
?常見癌癥驅動基因突變
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值得信賴的技術
Illumina Methylation BeadChip支持表觀遺傳學領域的突破性研究已有十余年，迄今為止大多數已發表的全表觀基因組關聯研究（EWAS）都是利用MethylationEPIC或其前代產品HumanMethylation450完成的。因此，研究人員可受益于諸如Gene Expression Omnibus（GEO）或癌癥基因組圖譜計劃（TCGA）數據庫中公開的大量甲基化芯片數據。
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兼容多種樣本類型，包括FFPE
Infinium甲基化檢測的可靠性有助于從FFPE組織樣本獲得高質量數據。FFPE兼容性對于癌癥研究極為重要，能夠支持以大型腫瘤生物樣本庫為基礎的研究。Infinium檢測同樣兼容新鮮/冷凍組織、全血、口腔細胞、cfDNA、唾液和其他樣本類型。
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歐易為935K甲基化芯片提供的分析：
具體報告內容請詳詢銷售。
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送樣要求：
樣品類型：細胞（1×106 個）、新鮮組織（ 100 ~ 200 mg）、血液（1ml）或 DNA 樣（1ug）
福爾馬林固定后石蠟包埋（FFPE）樣本：10 片以上 10 μm ?切片或石蠟塊
樣品質量：DNA主帶清晰且無明顯降解，OD 260/280 在 1.8 ~ 2.0
樣品保存：血液樣品、細胞樣品或新鮮組織塊（切成 50mg 的小塊）可液氮凍存后，-80 度保存，DNA 樣品可溶于乙醇或超純水中，-80 度保存，樣品保存期間避免反復凍融。樣品置于 1.5ml 進口凍存管中，封口膜封好
生物學重復：為了消除單個樣本變異產生的偏差，每組推薦設置3個以上生物學重復
上海歐易生物醫學科技有限公司（簡稱：“歐易生物”），成立于2009年，經過十多年穩健發展，已經成長為擁有“晶準生物”“鹿明生物”“青島歐易”三家全資子公司，近600名員工的生物科技領域集團型企業。
歐易生物始終秉持著“硬數據 · 好服務”的理念服務于大眾。為大生命科學、大健康相關研究領域，以及醫藥、食品及日化企業的客戶，提供從基礎研究到藥物靶點發現、藥理藥效及安全性評價、疾病分子標志物篩選、致病菌及耐藥菌溯源等相關技術服務，全力加速客戶研究與開發進程，提升客戶研究與開發價值。
歐易生物攜手旗下子公司，實現了中心法則上、中、下游多層組學的串聯，從基因組、轉錄組、表觀組、微生物組，到蛋白組、代謝組及近年熱門的單細胞&空間多組學技術服務，為科研用戶提供全面的創新多組學技術服務。
歐易生物已先后獲得閔行區研發機構、閔行區企業技術中心、上海市科技小巨人企業、產權管理體系認證企業等資質。擁有授權發明專利30+項，在受理發明專利50+項，軟件著作權150+項。
END
排版人：小久
原創聲明：本文由歐易生物(OEBIOTECH)學術團隊報道，本文著作權歸文章作者所有。歡迎個人轉發及分享，未經作者的允許禁止轉載。
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