牛油果無間隙參考基因組組裝助力脂肪酸生物合成和抗病性相關基因鑒定
牛油果屬樟科鱷梨屬常綠喬木，原產于中美洲。為闡釋牛油果的遺傳信息，中國科學院西雙版納熱帶植物園植物基因組演化與次生代謝研究組利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等測序技術對西印度品種的牛油果進行了全基因組測序，并組裝了841.6Mb無間隙的牛油果基因組序列。
研究顯示西印度品種的牛油果包含40629個蛋白質編碼基因，應用迭代識別和聚類方法預測出12個染色體特異性的著絲粒序列（CSCR）。這些CSCR序列結構復雜，包含多種類型的轉座子。科研人員采用熒光原位雜交技術進一步驗證了牛油果基因組序列中所有預測的著絲粒、端粒和核仁組織區域的準確性。此外，研究鑒定了376個與疾病抗性相關的NLR基因以及128個與脂肪酸生物合成相關的基因。其中，在三酰甘油形成階段，FAD2基因在果實中特異性表達，這為研究牛油果中脂肪酸生物合成提供了新見解。
相關研究成果以A telomere-to-telomere gap-free reference genome assembly of avocado provides useful resources for identifying genes related to fatty acid biosynthesis and disease resistance為題，發表在《園藝研究》（Horticulture Research）上。研究工作得到國家自然科學基金、云南省博士后科學基金和云南省“云嶺學者”培養工程等的支持。
推薦
