一文詳解白銀命案偵查用的ystr技術原理
“這些年,我們一直沒有放松對案件的偵辦,最終還是靠科學技術破了案。”8月30日,鄭毅在接受澎湃新聞采訪時,屢次感嘆“科技是第一生產力”。今年,白銀警方開始建立Y-STR數據庫,這種DNA檢測技術最終發揮效用。
神秘的Y-STR DNA檢測技術到底是什么?其實就是PCR。
不要急,看一段摘要:
目前用于性別鑒定的 PCR 方法有基于不同性別間呈現有或無關系的基因序列( 如 ZFP) ,有基于類似于鋅指蛋白 ( ZFX、ZFY) 和牙釉蛋白( AML) 呈現不同性別特征的基因序列,還有基于廣泛存在于人類基因組中的一類具有男性特有的高度多態性的短串聯重復序列( Y -STR) 。
SRY( sex determining region Y,SRY) 是人類睪丸決定因子( testis determing factor,TDF) 的最佳候選基因。通過優選人類凝固血液的DNA提取方法,運用 SRY 基因設計的引物進行特異性PCR 擴增反應,不經儀器檢測而直接運用熒光染色確定其性別信息,為滿足偏遠山區基層偵辦隊伍在案發現場對快速鑒定血跡性別的需求。(一篇公安寫的文章)
怎么檢測?
1. 剪取1-2 cm2帶有混合斑的檢材(如內褲,床單,衛生紙等),放入1.5ml EP管中(注意留一定的備用檢材);
2. 向1.5ml EP管中加入1ml PBS或生理鹽水,充分混勻,浸泡2h;
3. 12,000rpm離心3 min,棄去上清.取沉渣,涂片,染色,找精子;
4. 向帶有精子及陰道脫落上皮沉渣的1.5ml EP管中加入500ul PBS液(或Tris-HCl)及1mg/ml的蛋白酶K 10 ul,充分混合,56℃消化1小時或過夜;
5. 12,000rpm離心10 min,棄上清;
6. 加入PBS 1 ml洗滌1次,12,000rpm離心10 min,盡量去除上清(用進樣器吸取);向沉淀(含精子)中加入少許Chelex-100(100-200ul)及濃度為20mmol/L的DTT 10-20ul,濃度為1mg/ml的蛋白酶K 20ul,0.4% SDS 5ul,渦旋混勻15sec,56℃消化2-3小時或過夜;
7. 混勻后置于沸水中煮10min;
8. 立即置于冰上3min;
9. 10000rpm離心1min,置于4℃冰箱中,備用
百度百科到此就結束了,起碼是熟悉的,能看懂的東西了,我對這個protocol其實還是有很多要吐槽的地方,比如為什么要重復蛋白酶K消化,消化完為什么還特意標注(含精子),你的精子是純棉的嗎,蛋白酶K都消化不了?沒有寫怎樣沉淀DNA,就開始溶解沉淀了。
維基百科上對Y-STR的解釋:
Y-STR Analysis
There are regions on DNA that are made up of multiple copies of short repeating sequences of bases (for example TATT) which repeat a variable number of times depending on the individual. These regions, called “variable number short tandem repeats” are what is looked at when performing STR analysis. The likelihood of two people having the same number of repeated sequences is extremely small, and becomes even smaller the more regions that are analyzed. This makes up the basis of short tandem repeat analysis.The cornerstone for this process, however, is polymerase chain reaction (PCR). This allows forensic scientists to make millions of copies of the STR regions. Gel electrophoresis then “yields the number of times each repeat unit appears in the fragment.” This allows for easy comparison of DNA.
看明白了吧,Y染色體上的“短重復序列”因為重復次數不同,長度因人而異。看到這里,有條件的小伙伴是不是可以擴增一下自己的STR了?不要想歪哦,口試子提點DNA就夠了。