表觀遺傳之組蛋白修飾—組蛋白乙酰化
大家好，我又來啦~~今天給大家放送的是表觀遺傳之組蛋白修飾相關的內容噢，組蛋白修飾也是一個比較復雜的過程，今天呢，我們就給大家講講組蛋白乙酰化及相關的產品。
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一 組蛋白修飾
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真核生物染色質的基本結構單位是核小體，它由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成，其中組蛋白八聚體包含 2 (H2A-H2B)二聚體和 1 個 (H3-H4)2四聚體。相鄰的核小體之間由連接 DNA (linker DNA) 及 連 接 組 蛋 白 H1 相 連 。
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組 蛋 白 H2A/H2B/H3/H4 屬于核心組蛋白，它們均具有典 型的球狀組蛋白折疊結構域(histone fold)，組成了 核小體的核心部分。而它們 N 端和 C 端的柔性帶電的尾巴則從核心區域伸出來，能夠被各種修飾酶共價修飾。組蛋白翻譯后修飾(post-translational modifications， PTMs) 主要包括乙酰化 （賴氨酸上）、 甲基化 （賴氨酸和精氨酸上）、磷酸化（絲氨酸上）、泛素化、SUMO 化和 ADP 核糖基化修飾等。組蛋白可以在翻譯后對其進行修飾，以改變組蛋白與DNA和核蛋白的相互作用，導致表觀遺傳變化，從而調節了許多正常的和與疾病相關的過程。今天我們給大家說說組蛋白乙酰化。
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二 組蛋白乙酰化修飾
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蛋白乙酰化：在乙酰基轉移酶的作用下，在蛋白質賴氨酸殘基上添加乙酰基的過程。
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組蛋白乙酰化：是一種翻譯后修飾，多發生在核心組蛋白N一端堿性氨基酸集中區的特定賴氨酸殘基，將乙酰輔酶A的乙酰基轉移到賴氨酸的sNH3+中和掉1個正電荷。由組蛋白乙酰轉移酶（HATs）和組蛋白去乙酰基轉移酶(histone deacetylase，HDACs)共同決定。
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HDAC四個主要類別：I類，II類，III類和IV類。這些分類基于它們與酵母蛋白質的同源性。
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I類：HDAC1，HDAC2，HDAC3和HDAC8
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II類：HDAC4，HDAC5，HDAC6，HDAC7，HDAC9和HDAC10
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III類：包括SIRT1至SIRT7在內的7個sirtuin。
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IV類：僅包含HDAC11。
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重要性：通過研究組蛋白乙酰化和組蛋白脫乙酰化，研究人員可以對“組蛋白密碼”有更多的了解，可以研發HDAC的藥物，組蛋白脫乙酰基酶抑制劑（HDACi）通常用作情緒穩定劑和抗癲癇藥，最近已被用作可能的癌癥，神經退行性疾病和炎性疾病的治療方法。
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接下來，帶來今天的主菜，也是大家最喜歡的產品推薦啦~~
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三 組蛋白乙酰化相關產品
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組蛋白乙酰化和組蛋白去乙酰化包括在組蛋白蛋白質的N末端尾部和核小體核心表面的賴氨酸殘基上添加或去除乙酰基。
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組蛋白提取試劑盒
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俗話說，磨刀不費砍柴功，在我們進行某項實驗之前首先需要做很多的準備工作，比如組蛋白修飾實驗，我們需要準備的是組蛋白。那么我們怎么來準備適合我們實驗需要的組蛋白呢？想必有不少同學會疑問我該買什么樣的提取試劑盒。不用擔心，Epigentek可為大家提供組蛋白提取試劑盒：
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OP-0006 EpiQuik Total Histone Extraction Kit(100)：
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適合從哺乳動物的細胞或者組織中提取總核心組蛋白(H2A, H2B, H3, and H4)，組蛋白提取物中的翻譯后修飾（PTM）保持完整，因此可與Epigentek的組蛋白修飾測定試劑盒一起使用，或用于組蛋白甲基化，乙酰化，磷酸化，SUMO化，泛素化，瓜氨酸化和ADP-核糖基化研究。
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OP-0007 piQuik Total Histone Extraction HT Kit:
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該試劑盒提供了一種簡單，高通量的酶標板方法，用于提取用于各種應用的組蛋白，包括組蛋白修飾，例如乙酰化，甲基化和磺酰化等，可用于直接從96孔板中培養的哺乳動物細胞中提取組蛋白。
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參考文獻：
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Jang K et. al. (August 2020). Effects of mineral methionine hydroxy analogue chelate in sow diets on epigenetic modification and growth of progeny.J Anim Sci.
Lee JE et. al. (September 2020). Regulation of a long noncoding RNA MALAT1 by aryl hydrocarbon receptor in pancreatic cancer cells and tissues. Biochem Biophys Res Commun.
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組蛋白乙酰化定量試劑盒
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組蛋白乙酰化，包括組蛋白H3和組蛋白H4，參與染色質結構的調節和轉錄因子向基因啟動子的募集。量化乙酰化組蛋白的總水平或特定賴氨酸的水平將有助于闡明基因激活的表觀遺傳調控，并有助于開發針對HAT或HDAC的藥物。
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參考文獻：
Fouad M et. al. (July 2020). Epigenetic Immunomodulatory Effect of
Eugenol and Astaxanthin on Doxorubicin Cytotoxicity in Hormonal Positive
Breast Cancer Cells BMC Pharmacology & Toxicology.
Oliveira GS et. al. (August 2020). Effect of exercise and grape juice on epigenetic modulation and functional outcomes in PD: a randomized clinical trial. Physiol Behav. :113135.
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組蛋白乙酰轉移酶（HAT）測定
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組蛋白乙酰基轉移酶（HAT）是在基因的轉錄調節中起關鍵作用的酶，通過選擇性地乙酰化位于核心組蛋白蛋白質氨基末端附近的賴氨酸的ε-氨基而直接對應于轉錄。確定HAT的活性及其抑制劑的功效有助于發現藥物和開發抗癌藥，以及更好地理解基因轉錄。
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P-4003? EpiQuik HAT Activity/Inhibition Assay Kit：
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用于測量總的組蛋白乙酰轉移酶活性或抑制率，活性HAT與組蛋白底物結合并使其乙酰化。輸入樣本為核提取物或者純化的酶，核提取物可搭配核提取試劑盒（op-0002或者op-0022）。可以用高親和力的抗乙酰化組蛋白抗體識別乙酰化底物。 直接與HAT酶活性成正比的乙酰化組蛋白的比例或數量可以通過ELISA樣反應進行比色定量。
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參考文獻：
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Wijenayake S et. al. (July 2020). Dynamic regulation of histone H3 lysine (K) acetylation and deacetylation during prolonged oxygen deprivation in a champion anaerobe. Mol Cell Biochem.
Cantacorps L et. al. (February 2020). Curcumin treatment attenuates alcohol-induced alterations in a mouse model of foetal alcohol spectrum disorders. Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. :109899.
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組蛋白脫乙酰基酶（HDAC）測定
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組蛋白脫乙酰基酶（HDAC），也稱為賴氨酸脫乙酰基酶（KDAC），是一類從核心組蛋白（H2A，H2B，H3和H4）除去乙酰基從而調節基因表達的酶。通過研究HDAC的活性和抑制作用，研究人員可以更好地了解組蛋白脫乙酰基對疾病和各種細胞過程的影響。
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前面我們介紹了HDAC分四大類有HDAC1~HDAC11和SIRT1~7，因此，我們的產品有針對這些HDAC的活性/抑制分析試劑盒。
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參考文獻：
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Chelladurai P et. al. (July 2020). Isoform-specific characterization of class I histone deacetylases and their therapeutic modulation in pulmonary hypertension.Sci Rep. 10(1):12864.
Pasquereau S et. al. (July 2020). Impact of glucocorticoids on systemic sirtuin 1 expression and activity in rats with adjuvant-induced arthritis. Epigenetics. :1-12.
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