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    兩篇Nature子刊發表基因組測序成果為新藥開發提供新線索

    2016.11.24

      科學家們對造成盤尾絲蟲病的寄生蟲進行基因組測序,揭示了這種寄生蟲的活動方式,鑒定了可以被現有藥物靶標的蛋白,為新藥和疫苗開發提供了線索。這項研究以兩篇文章的形式發表在本周的Nature Microbiology雜志上。

      據世界衛生組織(WHO)統計,全世界有一千八百萬人受到盤尾絲蟲病的影響,主要集中在撒哈拉以南的區域。這種疾病通過在河流邊生活的蚊蟲在人群中傳播,這些蚊蟲叮咬會帶來致病的盤尾絲蟲。盤尾絲蟲進入人體就會開始繁殖,其后代遷移到皮膚會引起劇烈瘙癢和皮疹,遷移到眼睛會造成眼部癥狀甚至失明。目前人們普遍用抗寄生蟲藥物伊維菌素進行治療,但完全治愈可能需要數十年時間。一些研究者認為,伊維菌素的廣泛使用會使寄生蟲對藥物發展出抗性。

      美國NIH過敏與傳染病研究所(NIAID)的研究人員收集厄瓜多爾、烏干達和西非的盤尾絲蟲(O. volvulus),對其完整基因組進行了測序,還重建了盤尾絲蟲體內共生菌Wolbachia的基因組。他們在此基礎上鑒定了一些關鍵的寄生蟲基因,這些基因編碼寄生蟲感染所必須的蛋白和分子反應。其中16個新發現的蛋白已經是現有藥物的作用靶標,但相應藥物此前還沒有用于盤尾絲蟲病的治療。

      十月十七日Nature Methods雜志發表的一項研究顯示,新測序技術與新算法的結合可以為人們揭示復雜基因組的詳細信息。加州大學戴維斯分校和Pacific Biosciences公司開發的FALCON-Unzip算法能夠將長讀取測序數據裝配成高度準確、連續和正確定相的二倍體基因組。

      前不久,浙江大學和Nebraska大學的科學家們在Nature Genetics雜志上發布了異源多倍體芥菜型油菜(Brassica juncea)的基因組序列。油菜在植物分類上屬于十字花科蕓薹屬,是世界廣泛種植的油料作物。這類植物擁有三個二倍體基因組和三個異源多倍體基因組。

      長頸鹿是身高接近六米的龐然大物,它們擁有異乎尋常的長脖子和大長腿,并且能夠高速奔跑。科學家們首次完成了長頸鹿及其近親(okapi)的基因組測序,揭示了推動長頸鹿進化的遺傳學改變。這項研究發表在五月十七日的Nature Communications雜志上。

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