PCR假陰性的原因分析
PCR假陽性問題是在PCR誕生之初就被深刻認識到了,同時由于造成假陽性的因素相對單一,因此假陽性并不是困惑檢驗工作的主要原因。如果一個項目只是陽性率高敏感性好的話,那么可以認為其陰性結果具備很高的可排除性,仍然有相當的臨床適用價值。但PCR的假陰性在檢驗工作中仍很嚴重,并且用些因素經常被人忽略,嚴重的影響了PCR的使用。可以想象一種假陽性和假陰性都很高的項目,有什么樣的診斷價值。
造成PCR假陰性的原因是復雜的,也是多樣的。主要有:
1.PCR儀本身的質量問題。PCR儀設計原理上的差異和經常出現的質量問題(如:溫控不準等)給臨床帶來了諸如非特異性擴增(假陽性)、擴增效率下降(假陰性)等問題。(具體另外講述)
2.離心機問題。離心機的質量或使用不正確,造成離心標本模板沒有分離出來造成假陰性,竊以為這是最易被忽視的問題。其時離心機使用問題不僅在PCR,在整個檢驗工作中都是最易被忽視的問題,只是因為在其他工作中不象PCR那樣明顯影響檢測結果罷了。
離心機是常用的固液分離設備,其利用離心過程中的離心力而將密度不同的物質分離出來。因此離心機的關鍵在于離心加速度而不是轉速,根據牛頓定律可知離心力加速度與轉速和有效半徑的有關的,因此對于不同有效半徑的離心機相同的轉速其離心加速度是不同的,轉速的調節要因離心機而異,但很遺憾,日常工作中忽視了這個問題。有效半徑短的離心加速度就小,同樣的時間離心效果就差可能造成分離不出導致假陰性。同時由于高速離心機高速旋轉與空氣摩擦會產生大量的熱,因此對于稱能上幾萬轉/分而沒有抽真空的離心機實際轉速本人持懷疑態度。
3.試劑開殼劑和操作問題造成標本DNA沒有暴露出來,致使擴增無法進行,這是造成假陰性的又一主要因素。
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