MALDI-TOF/TOF 和LC-MS/MS有什么區別
1、與LC／MS／MS相比，MALDI-TOF的識別結果不可靠，特別是當一個點中含有多個蛋白時。對于一個點的水解蛋白液來說，其中含有大量的多肽，并且經常含有修飾基團。一般來說，一個蛋白能水解出20～50種肽。用MALDI-TOF質譜測量多肽混合物時，待測組分不能完全離子化，對于一個蛋白得不到足夠的肽信息，無法搜索肽數據庫進行蛋白的識別。而LC-MS-MS聯用能夠檢測到相當高的肽段數量和氨基酸序列，這樣進行蛋白質識別就有了較高的可信度。
2、MALDI-TOF也不能進行翻譯后修飾蛋白質的分析。具有離子阱的LC-MS-MS技術能夠通過解析修飾導致的肽譜質量漂移提供修飾信息，并且能夠提供修飾類型和修飾位點的結構信息。
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