中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列(論文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示,該病毒與此前在中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關。
最近出現在中國武漢的一種嚴重呼吸道疾病現已傳播到中國其他地區和其他幾個國家,其中包括美國、德國和日本。首例患者于2019年12月12日被收治入院,調查發現武漢一家同時銷售野生動物的海鮮市場是此次疫情的潛在來源。
中國上海公共衛生臨床中心、復旦大學公共衛生學院的張永振及同事研究了一名41歲的男性海鮮市場工人,其于2019年12月26日在武漢一家醫院住院,表現出呼吸系統疾病癥狀,包括發燒、胸悶和咳嗽。聯合使用抗生素、抗病毒藥和糖皮質激素進行治療,但患者表現出呼吸衰竭,治療三天后病情無改善。
作者對從患者收集的支氣管肺泡灌洗液(肺分泌物)進行了基因組測序。他們鑒定出了一種新型病毒,并發現該病毒基因組與蝙蝠體內發現的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性。盡管從單個患者的分析中不可能得出該冠狀病毒是當前疫情爆發原因的結論,不過作者的這些發現已被針對其他患者的獨立調查研究證實。
*該研究得到的序列可在NCBI的SRA數據庫中找到(BioProject登記號為PRJNA603194)。病毒完整基因組已存入GenBank,登記號為MN908947。*
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