新一批敲除小鼠序列數據存入基因銀行
美國得克薩斯州基因組醫學研究所將其敲除小鼠庫的超過275000個核苷酸序列信息存入了美國國立衛生研究院的基因銀行。
以休斯敦為根據地的得克薩斯州基因組醫學研究所于今年5月加入國際敲除小鼠協會。在美國國立衛生研究院號召在國際科學界廣泛分享小鼠研究信息后,該研究所表示愿意向美國健康研究院提供基因序列信息。
得克薩斯州基因組醫學研究所表示,這些信息是從C57BL/6小鼠胚胎干細胞庫抽取,并且存入基因銀行的基因組調查序列分部。
該研究所表示,這次存入新型的規模是自1982年基因銀行創立以來最大一次。基因銀行GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/),是美國國家衛生院(National Institute of Health, NIH)于1988年成立,1992年起,資料庫即為Natioan Center for Biotechnology Information (NCBI)所管理。
美國國立衛生研究院(National Institutes of Health ,NIH)于2006年8月7日宣布將投資5千2百萬美元,啟動敲除小鼠計劃(Knockout Mouse Project),目的是建立一個完善、免費的小鼠基因組突變基因數據庫,并且用得到的基因突變小鼠品系幫助人類相關疾病研究。
NIH理事Elias A. Zerhouni說:“敲除小鼠是研究基因功能的有力工具,并且可以得到人類相關疾病動物模型。”基因敲除小鼠是被徹底“破壞”或者說敲除某個特定基因的小鼠品系。系統性地依次破壞小鼠基因組中20,000個基因中每個基因,有助于研究人員能夠更好地了解每個基因在正常生理條件下和發育過程中的作用。更為重要的是,研究人員可以利用基因敲除小鼠研發能夠為治療癌癥、心臟病、神經退行性疾病、糖尿病等人類遺傳性疾病提供更為優秀的動物模型。最近發展的DNA重組技術以及小鼠基因組測序工作的完成將使敲除計劃變的簡易。
Wellcome Trust Sanger研究室負責5000個基因,VelociGene division of Regeneron研究室負責3500個基因,兩個實驗室都根據得到的小鼠基因組測序結果設計載體,然后獲得每個基因相應的基因敲除小鼠干細胞。(實驗動物為C57BL/6 品系小鼠)其他實驗室將上述兩個單位研制的干細胞和載體應用與生物醫學研究。NIH打算將實驗數據進行收集和整理,建立一個敲除小鼠計劃數據中心。而且希望明年為敲除小鼠計劃建立一個倉庫,使所有實驗材料能夠對科研領域的每位成員開放。
NIH此項敲除小鼠計劃,將與加拿大北美小鼠條件突變計劃(North American Conditional Mouse Mutagenesis Project ,NorCOMM,生物通編者譯)和歐洲小鼠突變計劃(European Conditional Mouse Mutagenesis Program ,EUCOMM,生物通編者譯)合作,以避免重復工作。這三項計劃的目標都是獲得編碼小鼠大約20,000種蛋白的突變基因。三支研究小組達成協議:及時將研究結果公開發布。
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