T細胞受體測序(TCR seq)

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T細胞受體(T cell receptor，TCR)是T細胞表面特異性識別抗原和介導免疫應答的分子，是人類基因組 中多態性最高的區域之一，決定著人的免疫系統如何適應環境的變化。T細胞受體庫的多樣性(包括基因重組以及選擇性表達)直接反映了機體免疫應答的狀態。

TCR可分為TCRα/β和TCRγ/δ兩種類型, 外周血T細胞主要為TCRα/β的T細胞, 是介導機體特異性細胞免疫 反應的主要細胞。如圖1所示：TCRβ基因由可變區(V)、多變區(D)、結合區(J)和恒定區(C)四部分基因片段組成，形成互補決定區(complementarities determining region, CDR)和間隔的4個骨架區(framework region, FR)。

在T細胞發育過程中CDR1，2和FR區域相對保守，CDR3區由V、 D和J 進行重排(如圖2所示)而形成具有功能的TCR編碼基因(T細胞克隆)，由于V (65-100種)、D (2種)、J (13種)基因片段 本身具有多樣性，此外，由于在重排的過程中，在VD及D-J的連接區經常有非模板的核苷酸的隨機插入或刪除，進一步增加了CDR3區的多樣性(連接形成的多樣性約為2 × 1011)。

這種基因片段連接的不準確性使TCR的表達呈多樣性, 以識別各種不同的抗原。正常個體在無抗原刺激時，TCR基因重排是隨機的，因此正常人外周T細胞呈多家族、多克隆性特點。不同抗原(腫瘤、疫苗、病院微生物或者移植物等)刺激后，TCR V區基因可對該\抗原產生特異性識別，并使帶有這類基因的 T細胞得到優勢擴增，可用于分析不同 TCR V亞家族 T細胞的表達和利用。

T細胞受體測序(TCR seq)，采用多重擴增的手段獲取TCRβ的CDR3區域，結合高通量測序技術，結合生物信息學分析 手段，分析VDJ重排的方式等，廣泛應用于腫瘤免疫、自身免疫性疾病、器官移植免疫監測、疫苗注射免疫監測等領域。

技術特點

多重擴增：使用多組PCR引物 對TCRβ的CDR3區域進行擴增，而非探針捕獲

高通量：一次測序 得到百萬級別條數的序列信息

高準確性：從幾個到幾十萬個拷貝的精確計數

高分辨率：可以精確檢測至單堿基差異

重復性好：深度測序保證了檢測的隨機性，可不需技術重復

標簽: 免疫應答 T細胞受體庫 T細胞受體測序

作者：生物幫