真核細胞總RNA的制備
從細胞中分離RNA的純度于完整性對于許多分子生物學實驗至關重要。如Northern印跡與雜交分析、寡聚(dT)纖維素選擇分離mRNA,cDNA合成及體外翻譯等實驗的成敗,在很大程度上決定于RNA的質量。 RNA分離的最關鍵因素是盡量減少RNA酶的污染。 快速一步法提取總RNA 組織及有核細胞在勻漿過程中被變性液破膜、溶解,變性劑抑制RNA酶的活性,并使蛋白質變性及與核酸分離。經酸酚/氯仿將RNA抽提至水相,與DNA和蛋白質分離,再經異丙醇沉淀回收總RNA。 【 試劑 】 1×CSB緩沖液: 檸檬酸三鈉 25mmol/L pH7.0 十二烷基肌苷酸鈉 0.5% b-巰基乙醇 0.1mol/L 配制100ml 5×CS緩沖液:檸檬酸三鈉3.6762,十二烷基肌苷酸鈉2.5g溶于100ml 0.05%DEPC水中,過濾,15lb/in2, 20min,去DEPC,4°C保存。 用前100ml工作液加 b-巰基乙醇700ml。 4mol/L異硫氰酸胍變性緩沖液: 47.26g異硫氰酸胍加至100ml CSB緩沖液中。 配制:23.63g異硫氰酸胍加熱65°C溶于20ml無RNase水中,加10 ml 5×CS,加350ml b-巰基乙醇,用無RNase的水定量至50ml。(約加25ml水) 2mol/L 乙酸鈉NaAc(pH4.0): 16.4g乙酸鈉加至0.05%DEPC水40ml,用冰乙酸調pH至4.0,定容至100ml,分裝,高壓20min去除DEPC。 3mol/L 乙酸鈉NaAc (pH5.2): 24.6g乙酸鈉加至0.05%DEPC水80ml,用冰乙酸調pH至5.2,定容至100ml,分裝,高壓20分鐘去除DEPC。 水飽和酚(酸酚,pH4.0): 取重蒸酚200ml,于65°C水浴溶解,加100ml無RNase水混勻,靜置,取上層水相(大部分),加0.2g 8-巰基喹啉,混勻,保存于棕色廣口瓶,4°C待用。 【操作方法】 1. 組織勻漿:新鮮的或液氮凍存的組織,稱重后,按100mg組織/ml變性液,勻漿。置冰上30min。 培養細胞:貼壁細胞用PBS洗2次后,直接加2ml變性緩沖液/瓶;懸浮細胞用PBS洗沉淀2次,按107細胞/ml變性緩沖液,置冰上30min。 2. 取0.5ml粘稠液體加入1.5ml Eppendorf管(10ml塑料 離心管 )中,加50ml (1/10體積)2 mol/L NaAc(pH4.0),混勻。 3. 加0.5ml(等體積)酚和100ml (1/10體積的)氯仿:異戊醇(49:1),振蕩混勻,冰浴10min。 4. 4°C,12000g,20min。 5. 吸上層水相入新管,加等體積異丙醇,-20°C,至少1hr。 6. 4°C,12000g,20min。 7. 棄上清,沉淀用1ml預冷的70%乙醇漂洗,并移入Eppendorf管。 8. 4°C,12000g,10min。 9. 棄上清,室溫干燥蒸發殘存乙醇,數分鐘。 10.加100ml 水溶解RNA,測含量。 11.加1/10體積3mol乙酸鈉(pH5.2)和2.5倍體積預冷的無水乙醇置-30℃30min。 12.離心,12000g,15min. 13.棄上清,加預冷的70%乙醇1ml,12000g,離心5min。棄上清,室溫放置數分鐘。 溶解RNA:每20mg RNA加4.5ml水溶解RNA,4℃存放待轉膜(不宜久放)。