幾種果實總RNA提取方法的評價
廣東農業科學 陳弟 多種RNA 提取方法的原理 Trizol法即異硫氰酸胍—苯酚法,異硫氰酸胍可以抑制RNA酶、防止RNA的降解,而酚的作用是使蛋白變性。其原理是內含異硫氰酸胍能迅速破碎細胞,同時使核蛋白復合體中的蛋白變性并釋放出核酸;由于釋放出的DNA和RNA在特定pH值下的溶解度不同,且分別位于中間相和水相,從而使DNA和RNA得到分離;取出水相后,通過有機溶劑(氯仿)抽提及異丙醇沉淀,可得到純凈RNA。 熱硼酸法 (Hot-borate,簡稱HB法)的原理是將硼酸緩沖體系、蛋白酶K消化蛋白和LiC1選擇性沉淀RNA等步驟偶聯在一起。硼酸可與酚類化合物依靠氫鍵形成復合物, 二硫蘇糖 醇(DTT) 作為還原劑, NP-40 可阻止酚類物質氧化,聚乙烯吡咯烷酮(PVP)可與多酚化合物形成復合體,這些物質都可以抑制植物組織中酚類物質的氧化及其與RNA的結合,通過LiC1沉淀剩余的酚類物質,從而與RNA分開。 異硫氰酸胍法(Guanidine Thiocyanate,簡稱GT法)的提取液包括4 mol/L異硫氰酸胍、25 mmol/L檸檬酸鈉( p H 7.0 )、0.5%十二烷基肌酸鈉、0.1 mol/Lβ-巰基乙醇。其中,異硫氰酸胍作為強變性劑使核酸一蛋白結構發生變化,并有效解離核蛋白與核酸的復合體, 與β-巰基乙醇共同對RNase產生強烈的抑制作用,這樣能破裂細胞并迅速釋放核酸,然后通過CsCl梯度密度離心去除DNA,有效地得到總RNA。 十二烷基硫磺酸鈉法(Sodium Dodecyl Sulfate,簡稱SDS法) 的提取液有 0.1 mol/L Tris-HCl (pH8.0)、0.05 mol/L EDTA (pH8.0)、0.5 mol/L NaC1、1.5%SDS、0.01%β-巰基乙醇。 SDS 是一種離子去污劑,能從低離子強度溶液中沉淀核酸與酸性多聚糖;EDTA以螯合二價金屬離子,抑制RNA酶的活性,防止RNA降解;Tris-HCl不僅起緩沖作用,還可防止RNA降解;NaC1溶液可提供緩沖反應環境。在緩沖液中加入抗氧化劑或強還原劑(如β-巰基乙醇),可以降低酶類(尤其是氧化酶類)的活性。通過苯酚和氯仿等有機溶劑的抽提去除蛋白質、多糖和酚類等雜質后,加入無水乙醇進行沉淀,即可使RNA分離出來。 十六烷基三甲基溴化銨法(Hexadecyltrimethy Ammonium Bromide. 簡稱CTAB法)的抽提緩沖液包括2% CTAB、100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)、1.4 mol/L NaC1、20 mmol/L EDTA (pH 8.0)。其中,CTAB作為離子型表面活性劑,能溶解細胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,從而使RNA得以游離出來;EDTA以螯合二價金屬離子抑制RNA酶的活性,防止RNA降解;Tris-HCl不僅起緩沖作用,還可防止RNA降解;NaC1溶液提供緩沖反應環境。在緩沖液中加入抗氧化劑或強還原劑(如β-巰基乙醇) ,以降低酶類(尤其是氧化酶類) 的活性。而添加的苯酚和氯仿等有機溶劑能使蛋白質變性并使抽提液分相,由于RNA溶于水相,因此經離心后即可從抽提液中去除細胞碎片和大部分蛋白質;上清液中加入的無水乙醇可使 RNA沉淀,將沉淀出的RNA溶于TE溶液中即得RNA溶液;添加的還原劑(如β-巰基乙醇)和鰲合劑(如PVP) 可防止多酚氧化;低濃度乙醇或醋酸鉀可去除多糖,從而達到高度純化RN A的目的。