藥物設計與開發生物信息學

藥物設計與開發生物信息學 ? ??? 綜合運用現代蛋白 質技術等篩選到疾病靶標蛋白質以后，可以合理設計針對疾病靶標特點的先導化合物及其活性類似物。要想得到臨床藥物，還需要對其進行大規模活性篩選。 ? ??? 在“人類基因組計劃”完成后，藥物篩選有了很大發展。主要是運用計算機技術，以藥物靶標分子三維結構和蛋白質晶體結構為基礎，對含有大量化合物結構的數據庫進行模擬“篩選”，迅速高效地發現先導化合物及其新用途。這種藥物設計的方法是根據靶標分子與藥物分子相結合的活性部位的幾何形狀和化學特征，設計出與其相匹配的具有新穎結構的藥物分子。 ? ??? 使用這種方法需建立大量化合物的三維結構數據庫，然后將庫中的分子分別與靶標分子結合，通過不斷優化小分子化合物的位置以及分子內部柔性鍵的二面角，尋找小分子化合物與靶標大分子作用的最佳構象，計算其相互作用及結合能。在庫中所有分子均完成特異結合計算之后，即可以從中找出與靶標分子結合的最佳分子。