噬菌體展示庫(phage display library) 的基本原理是將外源基因同絲狀噬菌體 fd 或 MB 的外殼蛋白 P8 基因或 P3 基因融合后導入噬菌體基因組，表達產生的外源肽與外殼蛋白 P8 或 P3 形成融合蛋白，展示在噬菌體的表面。導入了各種各樣外源基因的一群噬菌體，就構成一個展示各種各樣外源肽的噬菌體展示庫。當用一個蛋白質去篩查一個噬菌體展示庫時，就會選擇性地同與其有相互作用的某個外源肽相結合，從而分離出展示庫里的某個特定的噬菌體，研究該噬菌體所含外源基因的生物學功能。 基于同一原理的另一種實驗系統是將編碼細菌表面的菌毛蛋白的基因，同外源基因融合，轉入細菌細胞后表達，在細菌表面的菌毛中出現融合蛋白。當遇到能同外源基因的蛋白質產物相互作用的蛋白質時就能選擇性地與融合蛋白相結合。這樣，也就起到展示庫的作用，可以篩選有相互作用的蛋白質。

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