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微生物多樣性分析

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產品介紹

環境微生物多樣性檢測，是以樣品中的微生物群落作為整體進行研究，通過對核糖體RNA高變區域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進行 PCR擴增和測序，然后分析相應環境下微生物群落的多樣性和分布規律，對于研究微生物與環境的關系、環境治理和微生物資源利用有著重要的理論和現實意義。

克隆文庫分析: PCR方法擴增特定環境樣品中細菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS，使用TA克隆方法構建克隆文庫，挑選陽性克隆測定基因序列，并與GenBank中已知序列進行同源性比較，獲得特定環境中的微生物群落結構和多樣性信息。
T-RFLP末端限制性酶切片段分析: PCR方法擴增特定環境樣品中細菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS，采用T-RFLP限制性內切酶對擴增產物進行限制性酶切，利用DNA分析儀分析末端限制性酶切片段，獲得末端限制性酶切片段長度，峰高及面積等信息，PAT數據庫分析比對獲得特定環境中的微生物群落結構及多樣性信息。
DGGE變性梯度凝膠電泳分析: PCR方法擴增特定環境樣品中細菌16SrDNA或真菌18SrDNA/ITS，通過變性梯度凝膠電泳分析環境樣品中微生物菌群落結構;將凝膠電泳條帶回收后克隆測序，確定微生物種屬關系，獲得特定樣品中的微生物多樣性信息。
高通量測序MiSeq分析: 采用第二代高通量測序平臺MiSeq，對核糖體RNA高變區域，比如16SrDNA/18SrDNA/ITS等序列，或功能基因，比如細菌和古菌的氨氧化酶基因進行測序，揭示環境樣品中眾多不同類型微生物種屬關系，獲得特定樣本中的微生物多樣性信息。

      DGGE變性梯度凝膠電泳

      變性梯度凝膠電泳是將DNA置于雙重變性條件(溫度和變性劑)下進行SDS-PAGE電泳的一種分析方法。當一雙鏈DNA片段通過一變性劑濃度呈梯度增加的凝膠時，此片段遷移至某一點變性劑濃度恰好相當于此段DNA的低熔點區的Tm值，開始解鏈，而高熔點區仍為雙鏈。這種局部解鏈的DNA分子遷移率發生改變，從而達到分離的效果。

      然而，一旦溫度(或變性劑濃度)達到DNA片段zei高的解鏈區域熔解溫度時，DNA片段會完全解鏈，成為單鏈DNA分子，此時它們又能在膠中繼續遷移。因此，如果不同DNA片段的序列差異發生在zei高的解鏈區域時，這些片段就不能被區分開來。在DNA片段的一端加入一段富含GC的DNA片段(GC夾子:一般30-50個GC堿基對)，能夠保證DNA片段zei高解鏈區域在GC夾子處，它的高解鏈溫度可以防止DNA片段在DGGE膠中完全解鏈。

      Tm的改變依賴于DNA序列，加了GC夾子后，DNA片段中基本上每個堿基處的序列差異都能被區分開。因此，理論上DGGE可以檢測DNA分子中的任何一種單堿基的替代、移碼以及缺失。

微生物多樣性分析由廣電計量檢測集團股份有限公司為您提供，如您想了解更多關于微生物多樣性分析報價、參數等信息，歡迎來電或留言咨詢。

注：該產品未在中華人民共和國食品藥品監督管理部門申請醫療器械注冊和備案，不可用于臨床診斷或治療等相關用途。

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