人工智能搜索引擎 CHIMERYS 助力快速、深度蛋白組覆蓋

全新的智能搜索引擎CHIMERYS?，是賽默飛與蛋白質組學人工 智能領域的領導者MSAID?的合作成果，是全新一代為解析混合 譜而生的人工智能算法。這種革命性的算法可以大大提升DDA 數據中被識別的PSM數量，從而實現鑒定數目性能上的巨大飛 躍。CHIMERYS 基于 INFERYS 算法[1]構建，其中 INFERYS 使用深 度學習模型預測肽段的 MS/MS 譜圖，CHIMERYS 進一步嘗試解 釋 MS/MS 譜圖中的每一個峰。因此，可以有效進行混合譜圖的解 析。 CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段和蛋白的鑒 定、非標記定量（LFQ）、TMT標記定量，不僅可改善鑒定蛋白 質的數量，還可提高定量性能。本文使用 Hela 標準肽段，在不同 分析梯度和樣品通量，包括8min到60min的5個不同梯度分別進行 DDA數據采集，對比 SequestHT 和 CHIMERYS 搜庫結果，在不同 梯度下，CHIMERYS 均有不同程度的提升，其中梯度越短，譜圖 越復雜，提升比例越高，表明 CHIMERYS 適合復雜譜圖的解析。 在使用 CHIMERYS 后，180SPD通量可獲得原來 60SPD 使用 SequestHT時一致的蛋白和肽段鑒定，提示我們在后續使用CHIMERYS進行數據解析可有效提高樣品分析通量。另外，本文中也對 CHIMERYS搜索結果的可信程度進行了討論。