人工智能搜索引擎 CHIMERYS 助力快速、深度蛋白組覆蓋

2023-06-29

文獻描述 免費下載此文獻

摘要

全新的智能搜索引擎CHIMERYS?，是賽默飛與蛋白質組學人工

智能領域的領導者MSAID?的合作成果，是全新一代為解析混合

譜而生的人工智能算法。這種革命性的算法可以大大提升DDA

數據中被識別的PSM數量，從而實現鑒定數目性能上的巨大飛

躍。CHIMERYS 基于 INFERYS 算法[1]構建，其中 INFERYS 使用深

度學習模型預測肽段的 MS/MS 譜圖，CHIMERYS 進一步嘗試解

釋 MS/MS 譜圖中的每一個峰。因此，可以有效進行混合譜圖的解

析。

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段和蛋白的鑒

定、非標記定量（LFQ）、TMT標記定量，不僅可改善鑒定蛋白

質的數量，還可提高定量性能。本文使用 Hela 標準肽段，在不同

分析梯度和樣品通量，包括8min到60min的5個不同梯度分別進行

DDA數據采集，對比 SequestHT 和 CHIMERYS 搜庫結果，在不同

梯度下，CHIMERYS

均有不同程度的提升，其中梯度越短，譜圖

越復雜，提升比例越高，表明 CHIMERYS 適合復雜譜圖的解析。

在使用 CHIMERYS 后，180SPD通量可獲得原來 60SPD 使用 Se-

questHT時一致的蛋白和肽段鑒定，提示我們在后續使用CHIME-

RYS進行數據解析可有效提高樣品分析通量。另外，本文中也對

CHIMERYS搜索結果的可信程度進行了討論。

下載此應用文獻

上一篇使用單四極桿電感耦合等離子體質譜法 (ICP-MS) 分析純金屬和鎳基高溫合金中的雜質

產品推薦

面議咨詢

面議咨詢

面議咨詢

面議咨詢