貨號 | 規格 | 操作 |
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20040525 | Library Prep Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (16樣本) | 詢底價 |
20040529 | Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (96樣本) | 詢底價 |
20040553 | Index Adapters IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A, Ligation (96標簽,96樣本) | 詢底價 |
20040554 | IDT for Illumina RNA UD Indexes Set B, Ligation (96標簽,96樣本) | 詢底價 |
20044764 | Services Illumina Stranded Total RNA Library Prep培訓 | 詢底價 |
使用多種樣本快速制備文庫,以極大的靈活性來研究編碼和非編碼轉錄組。
使用多種樣本快速制備文庫,以極大的靈活性來研究編碼和非編碼轉錄組。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus為編碼RNA和多種形式的非編碼RNA的分析提供了卓越的性能。能夠可靠地揭示替代轉錄本、基因融合和等位基因特異性表達。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus是基于TruSeq連接技術,自2011年起已被至少9926篇文獻引用。該連接方法具有覆蓋度均一性高、鏈信息精確的優勢,即使采用降解的樣本也能進行可靠的文庫制備。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus支持較寬的RNA起始量范圍(1 ng–1000 ng)。*它兼容多種類型樣本,包括福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)及其他低質量樣品。配備的Ribo-Zero Plus可從多個物種的樣本(包括人類、小鼠、大鼠、細菌和流行病學樣本)中去除大量RNA。
僅7個小時就可以完成文庫制備。Illumina將通自動化合作伙伴提供經Illumina認證的自動化方法。
在單次運行中可多重分析最多384個樣本。(Index Set A和B已上市,Set C和D即將推出。)每次運行測序的樣本數量取決于測序儀的通量。
*該起始量范圍適用于高質量的RNA。為獲得理想結果,針對FFPE或降解樣本,我們推薦的起始量為10 ng。
Description | 用于多種類型樣本的全轉錄組測序研究。包含Ribo-Zero plus模塊,一個試管即可去除多個物種的轉錄本。 |
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Content Specifications | 捕獲編碼RNA以及多種形式的非編碼RNA。 |
Assay Time | 約7小時 |
Hands-On Time | <3小時 |
Input Quantity | 對于標準質量RNA樣本,可使用1–1000 ng的總RNA。對于FFPE樣本,建議最少使用10 ng的總RNA,以獲得理想效果。 |
Mechanism of Action | 酶法rRNA去除,連接接頭和標簽 |
Multiplexing | 多達384個唯一雙標簽序列(UDI) |
Species Details | 包含Ribo-Zero Plus,用于去除多個物種的轉錄本,包括人類細胞質和線粒體rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、細菌革蘭氏+/- rRNA和人β珠蛋白轉錄本。 |
System Compatibility Details | 文庫制備被設計為與所有Illumina測序系統兼容,并在NextSeq 500/550和NovaSeq 6000系統上進行了大量的檢驗。 |
System Compatibility | HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
Variant Class | Novel Transcripts, Transcript Variants, 單核苷酸多態性 (SNPs), 基因融合, 轉錄變異 |
Species Category | 人類, 小鼠, Virus, 大鼠, 細菌 |
Specialized Sample Types | FFPE Tissue, Low-Input Samples |
Strand Specificity | Stranded |
Technology | 測序 |
Automation Capability | 液體處理機器人 |
Method | 全轉錄組測序 |
Nucleic Acid Type | RNA |
儀器 | 推薦的樣本數 | 讀長 |
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NextSeq 550 System | 中通量: 2 高通量: 8 (基于每個樣本50 M reads) | 2 × 75 bp |
NextSeq 2000 System | 全轉錄組分析: 每次運行8(P2)–20(P3)個樣本(基于每個樣本50 M reads) | 2 × 75 bp |
NovaSeq 6000 System | 全轉錄組分析: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 200 每次運行的樣本數(基于每個樣本50 M reads) | 2 × 75 bp |
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |
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Assay Time | 約7小時 | 11.5 hours | 11.5 hours |
Automation Capability | 液體處理機器人 | 液體處理機器人 | 液體處理機器人 |
Content Specifications | 捕獲編碼RNA以及多種形式的非編碼RNA。 | 捕獲編碼RNA以及多種形式的非編碼RNA。 | 捕獲編碼RNA以及多種形式的非編碼RNA。 |
Description | 用于多種類型樣本的全轉錄組測序研究。包含Ribo-Zero plus模塊,一個試管即可去除多個物種的轉錄本。 | For whole-transcriptome sequencing studies. The Total RNA version depletes cytoplasmic rRNA while the Total RNA Gold version depletes cytoplasmic and mitochondrial rRNA. | 用于血液來源RNA的全轉錄組測序研究。去除細胞質rRNA、線粒體rRNA和珠蛋白mRNA。 |
Hands-On Time | <3小時 | 5.5 hours | 5.5 hours |
Input Quantity | 對于標準質量RNA樣本,可使用1–1000 ng的總RNA。對于FFPE樣本,建議最少使用10 ng的總RNA,以獲得理想效果。 | 0.1 – 1 ug high-quality total RNA. Lower-quality samples may require further optimization. | 0.1–1 ug血液來源的高質量純化總RNA |
Mechanism of Action | 酶法rRNA去除,連接接頭和標簽 | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
Method | 全轉錄組測序 | 全轉錄組測序 | 全轉錄組測序 |
Multiplexing | 多達384個唯一雙標簽序列(UDI) | 低通量試劑盒:混合最多12個樣本。或混合24個樣本(組A和B一起), 高通量試劑盒:使用組合雙標簽或唯一雙標簽序列制備96個帶標簽的樣本。 | 高通量試劑盒:使用組合雙標簽或唯一雙標簽序列制備96個帶標簽的樣本。, 低通量試劑盒:混合最多12個樣本。或混合24個樣本(組A和B一起) |
Species Category | Virus, 人類, 大鼠, 小鼠, 細菌 | 人類, 大鼠, 小鼠 | 人類, 大鼠, 小鼠 |
Technology | 測序 | 測序 | 測序 |
上方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除多個物種的核糖核酸。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可在單試管反應中有效降低人類、小鼠、大鼠和細菌的rRNA濃度。將結果與TruSeq Stranded Total RNA配合Ribo-Zero Gold(哺乳動物種屬)和Ribo-Zero Bacteria(大腸桿菌)的結果進行比較(枯草芽孢桿菌數據未顯示)。下方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除人外周血白細胞中的珠蛋白mRNA。
Illumina Stranded Total RNA Prep為(A)高質量和合成降解的UHR RNA(RIN = 2)和(B)起始量為100 ng和10 ng的FFPE RNA提供了高覆蓋度均一性。FFPE樣本的DV200質量分值為55%。所有文庫都在NovaSeq 6000系統上以50 M reads進行測序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1進行數據分析。
上方- 性能參數比較——將Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus與TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero進行比較。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更高效,尤其是在使用10 ng和1 ng的低起始量總UHR RNA的情況下。在NextSeq 550系統上對文庫進行測序,下采樣至30 M reads。通過下采樣至4 M reads 來計算重復比例,并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0進行分析。下方- Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 的性能參數。
Illumina Stranded Total RNA Prep 在(A)1 ng和100 ng UHR RNA的起始量和(B)10 ng FFPE RNA的技術平行分析之間實現了高數據一致性。文庫在NovaSeq 6000系統上以2 × 74 bp讀長進行測序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1進行數據分析。
Illumina Stranded Total Prep提供了快速的工作流程,且手動操作時間短。時間長短會因使用的設備、處理的樣本數量、自動化程序或用戶經驗而異。
上方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除多個物種的核糖核酸。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可在單試管反應中有效降低人類、小鼠、大鼠和細菌的rRNA濃度。將結果與TruSeq Stranded Total RNA配合Ribo-Zero Gold(哺乳動物種屬)和Ribo-Zero Bacteria(大腸桿菌)的結果進行比較(枯草芽孢桿菌數據未顯示)。下方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除人外周血白細胞中的珠蛋白mRNA。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus由Illumina因美納(中國)科學器材有限公司 為您提供,如您想了解更多關于Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus報價、CAS號、貨號、參數等信息 ,歡迎來電或留言咨詢。
注:該產品未在中華人民共和國食品藥品監督管理部門申請醫療器械注冊和備案,不可用于臨床診斷或治療等相關用途。