紅細胞全面代謝組學研究的最大化代謝物提取方法
摘要
代謝組學是對一系列相似的生物樣本中的代謝物進行比較分析的學科。代謝物在生物系統中起著至關重要的作用,因此代謝組學可用于發現和鑒定生物標志物,或更好地了解藥物或疾病對已知和未知生物通路的影響。成功的代謝物組學研究依賴于有效的代謝物提取。對于非靶向代謝組學研究,需要提取細胞和體液中的多種代謝物,并去除無需分析的蛋白質等成分。再加上代謝物的理化性質多樣,豐度動輒相差若干數量級,更進一步增加了提取的難度。液液萃取這種兩相分離方法常被用于代謝物的提取。液液萃取中有機溶劑和水溶液的性質、體積、溶劑比例、水溶液的pH 值都必須仔細考慮。這些因素會顯著影響提取的代謝物數量和實驗的重現性。本應用報告介紹了采用液液萃取提取紅細胞代謝物的方法。結果表明,調整水相/有機相的比例對于兩相分離非常重要。同時水相pH 值對提取的代謝物數量也有很大影響,為了提取盡可能多的代謝物,需要采用多個pH 值進行提取。
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