采用多模式電離質譜策略解讀代謝組學的復雜性

Nordström A, Want E, Northen T, Lehtiö J, Siuzdak G. Anal Chem. 2008 Jan 15; 80(2): 421-9. Epub 2007 Dec 18.

摘要：本文介紹了一種分析人血清提取物的多模式質譜策略。將色譜分離與正、負離子兩種模式的大氣壓電離技術— 電噴霧電離(ESI) 和大氣壓化學電離(APCI) 在線聯用。另外，還通過組分收集和離線質譜法，將分離與表面基質輔助激光解吸附/電離(MALDI) 和多孔硅表面解吸附質譜(DIOS) 結合。用XCMS 軟件對原始數據進行處理，得到與時間對應的離子特征，定義為特定保留時間的特定m/z。通過對比ESI 和APCE+/- 模式所獲得的LC/MS 離子特征列表，得到特征離子列表。將非冗余的特征離子定義為，在相同保留時間內用其它電離方法未觀察到[M + H](+)、[M - H](-) 或[M + Na](+) 離子的質量數。用ESI+/- 兩種模式分析血清提取物，可以使(-) ESI 模式檢測到的額外特征離子增加90% 以上。用APCI 輔助ESI 分析，可以使特征離子數增加20%。最后，將ESI/APCI 電離與餾分收集和離線-MALDI 和DIOS 質譜法相結合。將LC-MS 總離子流色譜中相當于收集的餾分的各部分加總，將得到的m/z 列表與DIOS/MALDI 質譜圖所得到的m/z 列表進行比較。可以看出，每個餾分DIOS 能檢測到的特定離子約占50%。結果表明，真正全面的代謝組學，需要采取多種電離技術，以解決固有的代謝物多樣性造成的代謝組學研究的復雜性。