用分子式和METLIN 個人代謝物數據庫匹配對LC/TOF-MS 得到的數據進行化合物鑒定

Sana TR, Roark JC, Li X, Waddell K, Fischer SM. J Biomol Tech. 2008 Sep; 19(4): 258-66.

摘要：為了簡化從液相色譜-飛行時間質譜所得代謝組學數據中鑒定化合物的步驟，我們編寫了構建個人代謝物數據庫的軟件，該數據庫包含從公共METLIN 數據庫(http://metlin.scripps.edu/) 中獲取的15,000 多種化合物。此外，我們還為數據庫增添了其它功能，如，(a) 用戶可以在數據庫中添加保留時間并將其作為獨立的可檢索參數，作為精確質量數檢索的補充;(b) 可以外接獨立的分子式生成軟件(MFG)，為精確質量質譜數據與數據庫的匹配提供可靠的解釋。為了驗證這一鑒定策略的實用性，我們將78 個合成尿標準品的保留時間添加到該數據庫的子集中。然后對這些合成物的混合物進行分析并用上述METLIN 尿數據庫篩查，結果有46 個的精確質量和保留時間都匹配。接下來，在同樣條件下用該數據庫對人體尿液樣品進行了分析和篩查。人體尿液中共檢測到1387 個離子;其中有16 個的精確質量數和保留時間與數據庫相匹配。另有374 個只有精確質量數與數據庫匹配，其中163個質量數的MFG 分值最高。另外，MFG 計算出了與數據庫無法匹配的849 個離子的分子式。總體而言，這些結果表明METLIN個人代謝物數據庫和MFG 軟件為驗證數據庫匹配化合物的分子式提供了可靠的策略。對于數據庫無法匹配的離子，也會提出可能的分子式，可能對實驗結果的解釋有所幫助。