多種方法分析斑馬魚(Danio rerio) 肝臟代謝譜
Ong ES, Chor CF, Zou L, Ong CN. Mol Biosyst. 2009 Mar; 5(3): 288-98. Epub 2008 Dec 24.
摘要:用多種平臺方法,包括1H NMR、GC/MS 和LC/MS,對雄性和雌性斑馬魚(Danio rerio) 的肝臟生化譜進行了代謝組學研究。測定前驗證了三種方法的重現性和可靠性。某種方法檢測到的主要生物分子,再用其它方法進行交叉驗證。這些代謝物包括用1H NMR 和GC/MS 測定的碳水化合物、脂類、氨基酸,用1H NMR 和LC/MS 測定的乙酰肉堿、膽堿和各種磷脂。我們的結果表明,1H NMR 能夠提供了斑馬魚肝臟中葡萄糖、氨基酸、丙酸酯和其它小分子生化組分的全面信息。另外,GC/MS 適用于分析膽固醇、飽和和不飽和脂肪酸,而LC/MS 最適合分析脂類/磷脂。這些技術顯示,雄性和雌性斑馬魚肝組織提取液的生化譜有明顯差異。特別地,我們注意到雖然雄性和雌性斑馬魚肝臟的碳水化合物譜沒有明顯區別,但氨基酸譜差異卻相當明顯。另外,三種技術的數據表明,雖然飽和脂肪酸譜相似,但兩種表型中不飽和脂肪酸譜卻不同。上述結果提示,這種多平臺方法可對代謝組進行全面檢測,并為人們理解生物系統中差異性生化譜的意義提供了有價值的信息。
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