用TripleTOF 5600高分辨質譜的Profile工作流對多肽同時定性和定量

摘要：基于質譜數據的蛋白質定量分為兩類：基于同位素標記的MS/MS掃描或者MRM掃描和基于非同位素標記的MS掃描。運用TripleTOF 5600系統，首次能將所有的蛋白質定量流程在單一的平臺上完成。TripleTOF 5600系統集高靈敏度、高分辨率、高掃描速度、高質量準確度于一身。針對MS掃描，TripleTOF 5600擁有高分辨、高質量精度的飛行時間質譜性能，具有較寬的動態范圍可鑒定中等復雜生物樣品中的肽段；與此同時，TripleTOF 5600還具備高分辨、高靈敏的MS/MS快速采集速度，從而對樣品進行深入表征。這種完美的結合使得TripleTOF 5600系統在一次進樣完成對肽段同時定性和定量。

實驗儀器

Eksigent nanoLC-Ultra 2D 系統

TripleTOF 5600

QTRAP 5500

MultiQuant 軟件

結論

通過實驗可得到：在中等復雜的樣品中，TripleTOF 5600系統運用Profile工作流程可提供同三重四極桿相媲美的定量性能。對含5種目標肽段及同位素標記肽段的蛋白質組學定量標準分析，結果比預期的輕/重肽段比定量精度高。